Le département de l'Allier a été créé le 15 janvier 1790, ses limites sont quasiment celles de l'ancienne Province de Bourbonnais. Il doit son nom à la rivière qui le traverse. Moulins en est devenue la préfecture le 28 janvier 1790.

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Depuis les lois de décentralisation du 2 mars 1982 ("Le Conseil Général règle par ses délibérations les affaires du département"), le Département est devenu, une collectivité territoriale dotée de compétences propres. Il est administé par une assemblée formée de conseillers généraux, avec à leur tête un président.

Le département intervient dans différents domaines tels que : l'action sociale, l'éducation, la culture, les transports, etc....

Au sein des services du Conseil général, la Direction de l'Agriculture et de l'Environnement (DAE) a en charge les dossiers concernant l'eau.
Elle est constituée de 4 services :

Bureau Départemental de la Qualité de l'Eau (BDQE),

IPL Laboratoire d'Analyses de l'Allier

Service Environnement (SE),

Service de l'Agriculture, de la Forêt et de l'Aménagement Rural (SAFAR).